Agroindustrias San Jacinto S.A.A. cuenta con la Certificación de Calidad ISO 9001:2015 e ISO 45001:2018 para los productos: azúcar y alcohol en sus diferentes presentaciones, a través del cual, asegura la satisfacción del cliente, la mejora continua de sus procesos, así como la seguridad y salud de sus colaboradores.

Además, cuenta con el Sistema HACCP, el cual es validado por la Dirección General de Salud Ambiental (DIGESA), en la Validación Técnica Oficial del Plan HACCP, que involucra el cumplimiento de las Buenas Prácticas de Manufactura (BPM) y los Programas de Higiene y Saneamiento (PHS), lo cual garantiza a sus clientes, la inocuidad del producto (azúcar) .